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将阿法替尼IC50值与吉非替尼的IC50值进行比较时，人们发现耐*性增加的顺序几乎相同，唯一例外的是SCC25和SCC58，它们均对阿法替尼敏感，但对吉非替尼耐*。这表明阿法替尼对于表达高水平EGFR的癌症可能是更好的治疗选择，并且与吉非替尼相比可能与阿法替尼的更广泛的ErbB抑制作用有关。由于吉非替尼仅抑制EGFR，而阿法替尼靶向EGFR，HER2和HER4，因此一种可能存在于HER2信号转导的差异中。
PTEN表达在阿法替尼国产仿制*耐*中也不起作用，因为在所有细胞系中表达水平均相似。可以解释功效差异的主要因素是不可逆的结合模式以及阿法替尼对ErbB信号网络的预期更严格的阻断。但是，在解释体外数据时应采取谨慎措施，例如SCC35，其对阿法替尼的IC50最高，但仍对体内*物敏感。
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